Есть такая модель мира, называется материализм. Основами материализма являются три сущности - материя, пространство и время. Основ именно три, и они в материализме никак не связаны между собой. Они просто есть.
Энергия в материализме является производной величиной. Т.е. энергия - это способность материи перемещаться в пространстве за единицу времени. Энергии как основной сущности в материализме нет.
Дядечка Энштейн попытался создать _другую_ модель мира, в которой между сущностями материализма есть связь (т.е. он предположил, что есть какая то другая, единая, сущность, а материя, пространство и время являются ее производными). Но это уже не материализм, а другая модель мира.
Так вот - первая формула относится к материализму, а вторая не относится. Поэтому сравнивать их нельзя. Это как сравнивать тёплое с мягким. Поэтому деление на два никуда не девалось - это просто формулы из разных моделей.